5' ITR: 5' inverted terminal repeat. 野生株の5' ITR と3' ITRは基本的に同じ配列を持つ。ウイルスゲノムの両端に逆向きに配置され、ウイルスゲノムの複製起点として機能する。
Ψ: アデノウイルスゲノムDNAのパッケージングシグナル。
U6 promoter: ヒトU6 snRNAのプロモーター。small RNAの転写をするRNAポリメラーゼIIIによってgRNAを高レベルで発現する。
gRNA: Streptococcus pyogenes由来のCas9(SpCas9)用のgRNA。
Terminator: gRNAの転写を停止する。
CBh promoter: チキン β‐アクチンプロモーター。下流のCas9ヌクレアーゼを発現する。
Cas9 protein: Cas9遺伝子。
TK pA: 単純ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼのポリアデニレーションシグナル。上流ORFの転写を停止する。
ΔAd5: アデノウィルス5型(Ad5)ゲノム。E1A、E1B、E3領域が欠損している。
3' ITR: 3' inverted terminal repeat。
pBR322 ori: pBR322複製起点。E.coliでプラスミドを中コピー数で維持する。
Ampicillin: アンピシリン耐性遺伝子。 E.coliへのアンピシリン耐性によるプラスミドの維持を可能にする。
PacI: PacI制限酵素認識サイト(TTAATTAA)。2ヵ所のPacIサイトで切断することによってベクターを線状化し、ベクターバックボーンを取り除いて効率的なパッケージングを実現する。
デュアルgRNA アデノウィルスCRISPR ベクター
5' ITR: 5' inverted terminal repeat. 野生株の5' ITR と3' ITRは基本的に同じ配列を持つ。ウイルスゲノムの両端に逆向きに配置され、ウイルスゲノムの複製起点として機能する。
Ψ: アデノウイルスゲノムDNAのパッケージングシグナル。
U6 promoter: ヒトU6 snRNAのプロモーター。small RNAの転写をするRNAポリメラーゼIIIによってgRNAを高レベルで発現する。
gRNA #1: Streptococcus pyogenes由来のCas9用のgRNA#1。
gRNA #2: Streptococcus pyogenes由来のCas9用のgRNA#2。
Terminator: gRNAの転写を停止する。
CBh promoter: チキン β‐アクチンプロモーター。下流のCas9ヌクレアーゼを発現する。
Cas9 protein: Cas9遺伝子。
TK pA: 単純ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼのポリアデニレーションシグナル。上流ORFの転写を停止する。
ΔAd5: アデノウイルス5型(Ad5)ゲノム。E1A、E1B、E3領域が欠損している。
3' ITR: 3' inverted terminal repeat。
pBR322 ori: pBR322複製起点。E.coliでプラスミドを中コピー数で維持する。
Ampicillin: アンピシリン耐性遺伝子。 E.coliへのアンピシリン耐性によるプラスミドの維持を可能にする。
PacI: PacI制限酵素認識サイト(TTAATTAA)。2ヵ所のPacIサイトで切断することによってベクターを線状化し、ベクターバックボーンを取り除いて効率的なパッケージングを実現する。