既製品CRISPRライブラリー

ベクタービルダーは、CRISPRスクリーニング用に高品質な既製品gRNA発現レンチウイルスライブラリーを提供します。これらのライブラリーは、ホールゲノムからパスウェイ特異的なものまで、様々なスケールで遺伝子のアップレギュレーションやダウンレギュレーション、または遺伝子のノックアウトが出来ます。費用対効果の高い、強力なCRISPRスクリーニングツールとなります。個別の研究ニーズに合わせたカスタムCRISPRライブラリーの構築も受託しています。

既製品CRISPRレンチウイルスライブラリー
  • ホールゲノムCRISPRノックアウトライブラリー
  • ホールゲノムCRISPRa ライブラリー
  • ホールゲノムCRISPRi ライブラリー
  • パスウェイ特異的CRISPR ノックアウトライブラリー

注文方法

注意事項:

1.既製品CRISPRライブラリーの納品物はready-to-useレンチウイルス粒子となります。レンチウイルスの容量についてはこちら

2.ご注文、またはライブラリーをカスタマイズしたい場合は、デザインサポートをご依頼ください

ホールゲノムCRISPRノックアウトライブラリー
製品名 総遺伝子数 総gRNA数 スケール 価格 (税別、送料別) 参考文献
ヒト ホールゲノム dual-gRNA ライブラリーHOT 20,048 91,926 (pairs) 中容量 465,000円 View
プラス 542,500円
マウス ホールゲノム dual-gRNA ライブラリーHOT 20,493 90,344 (pairs) 中容量 465,000円
プラス 542,500円
ヒトGeCKO V2 ライブラリー A 19,050 65,383 中容量 310,000円 View
プラス 387,500円
ヒトGeCKO V2 ライブラリー B 19,050 58,028 中容量 310,000円
プラス 387,500円
ヒトGeCKO V2 ライブラリー A + B 19,050 123,411 中容量 310,000円
プラス 387,500円
マウスGeCKO V2 ライブラリー A 20,611 67,405 中容量 310,000円
プラス 387,500円
マウスGeCKO V2 ライブラリー B 20,611 62,804 中容量 310,000円
プラス 387,500円
マウスGeCKO V2 ライブラリー A + B 20,611 130,209 中容量 310,000円
プラス 387,500円
ヒト ホールゲノムCROP-seq KOライブラリー 19,050 123,411 中容量 635,500円

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プラス 713,000円
マウス ホールゲノムCROP-seq KOライブラリー 20,611 130,209 中容量 635,500円
プラス 713,000円
ヒト ホールゲノムPerturb-seq KOライブラリー 19,050 123,411 中容量 775,000円

View Ref 1

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プラス 852,500円
マウス ホールゲノムPerturb-seq KO ライブラリー 20,611 130,209 中容量 775,000円
プラス 852,500円
ホールゲノムCRISPRaライブラリー
製品名 総遺伝子数 総gRNA数 スケール 価格 (税別、送料別) 参考文献
ヒトCRISPRa (SAM)ライブラリー 23,430 70,290 中容量 635,500円 View
プラス 713,000円
マウスCRISPRa (SAM) ライブラリー 23,439 69,225 中容量 635,500円
プラス 713,000円
ホールゲノムCRISPRiライブラリー
製品名 総遺伝子数 総gRNA数 スケール 価格 (税別、送料別) 参考文献
ヒトCRISPRi ライブラリー 23,430 70,290 中容量 635,500円 View
プラス 713,000円
マウスCRISPRi ライブラリー 23,439 69,225 中容量 635,500円
プラス 713,000円
パスウェイ特異的CRISPR ノックアウトライブラリー
製品名 総遺伝子数 総gRNA数 スケール 価格 (税別、送料別) 参考文献
DNA損傷応答遺伝子MKOv4ライブラリー 460 4,530 中容量 372,000円 View
ヒト エピジェネティック遺伝子KO ライブラリー 2,508 20,051 中容量 542,500円 View
ヒト ユビキチン修飾関連遺伝子KOライブラリー 660 11,108 中容量 434,000円 View
ヒト 転写因子KOライブラリー 1,639 11,364 中容量 434,000円 View
ヒト 代謝関連遺伝子KOライブラリー 2,981 30,290 中容量 542,500円 View
ヒト キナーゼドメインKOライブラリー 482 3,051 中容量 372,000円 View
ヒトRNA結合タンパク質KOライブラリー 725 8,260 中容量 434,000円 View
CRISPRレンチウイルスライブラリーのタイターと容量
スケール アプリケーション タイター 容量
中容量 細胞培養およびin vivo >108 TU/ml 1 ml (10x100 ul)
プラス 細胞培養およびin vivo >108 TU/ml 5 ml (50x100 ul)

技術情報

製品特長

NGSによるライブラリーの品質検証

ベクタービルダーのライブラリーは、次世代シーケンサー(NGS)による厳格な品質検証によって高いリードアライメント率と均一性の面で、卓越した性能を示しています。

信頼性の高いレンチウイルスシステムと高タイターのready-to-useレンチウイルス

ベクタービルダーのCRISPRレンチウイルスライブラリーは、広範な細胞に対して高いトランスダクション効率を持つVSV-Gシュードタイプレンチウイルスを使用します。レンチウイルスベクターは効率的、永続的かつ均一にgRNAを細胞へ導入することができるため、in vitro遺伝子スクリーニングに理想的です。すべてのプール型CRISPRライブラリーは高いタイター(>108 TU/ml)をもち、ready-to-useレンチウイルスとして提供されるため、ウイルスのパッケージングやタイター測定の時間を省略できます。第3世代のレンチウイルスベクターシステムは自己複製が不可能であり、バイオセーフティが向上しています。

関連書類
冊子とフライヤー
       デュアルgRNAライブラリー

FAQ

シングルgRNAライブラリーと比較して、デュアルgRNAライブラリーの利点は何?

デュアルgRNAライブラリーは、シングルgRNAライブラリーよりもはるかに強力なノックアウトスクリーンが可能です。なぜなら、デュアルgRNAライブラリーは標的配列に大きな配列欠失を導入できるため、機能喪失突然変異の発生効率がはるかに高いからです。デュアルgRNAライブラリーの各CRISPRベクターには、同じ遺伝子を標的とする一対のgRNAが含まれます。デュアルgRNAライブラリーがCas9を発現する細胞に導入されると、各ベクターは同じ標的遺伝子に2つの切断を作り出し、細胞が2つの切断部位の壊れた末端を修復しようとすると、2つの標的部位にまたがる大きな欠失が生じます。Cas9/gRNAによる2つの切断部位は、標的遺伝子の機能的に重要な領域を挟むようにデザインされているので、この2つの部位にまたがる欠失は遺伝子機能の喪失につながる可能性が高まります。

CRISPRノックアウトスクリーンでは、1ベクターシステムと2ベクターシステムのどちらを使うべき?

典型的なノックアウトスクリーニングの場合、プール型CRISPRライブラリーは1ベクターシステムまたは2ベクターシステムのどちらの形式でも構築できます。1ベクターシステムではCas9またはCas9バリアントは同じベクターからgRNA(複数可)と共発現されます。2ベクターシステムではCas9またはCas9バリアントとgRNA(複数可)は2つの別々のベクターから発現されます。2ベクターシステムでは、gRNA発現ベクターをCas9安定的発現する細胞株に導入するオプションも選択できます。1ベクターシステムの利点は、細胞への2つの異なるベクターの共導入/トランスダクションを回避できること、およびCas9発現安定細胞株の入手可能性に制限されないことです。しかし、2ベクターシステムに比べると汎用性が低く、クローニングやウイルスパッケージングの効率が劣ることがあります。

gRNA特異性スコアの計算方法は?

ベクタービルダーはgRNA特異性スコアの計算にCRISPRライブラリーデザイン(CLD)のアルゴリズム を使用しています。 ある生物のN(20)NGG配列を標的とするgRNAを例にとると、ゲノム内で標的配列と3つ以下のミスマッチを持つ潜在的なオフターゲット配列すべてを検索します。次にそれぞれの潜在的なオフターゲット配列について、オフターゲットスコアが計算されます。すべてのオフターゲットスコアを集計して最終的なgRNAの特異性スコアを算出します(0から100までで数字が大きいほど高い特異性を示す)。 特異性スコアは大まかな指標に過ぎないことに留意してください。実際の効率性や特異性はスコアが予測するものとは異なる可能性があります。スコアの低いgRNAでもうまく機能することもあります。

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