ライブラリースクリーニング

ライブラリーデザイン

スクリーニングを成功させるためには、目的に適したライブラリーを設計することが重要です。ベクタービルダーの専門チームは、エラーが起こらない効率的なクローニングを可能にし、様々なスクリーニングに適切なマーカーまたはバーコード配列を含む、かつ信頼性の高い結果を得るために高シグナル/ノイズ比を実現できるライブラリーベクターのデザインをサポートしています。研究ニーズに応じて、s レンチウイルス、AAV、アデノウイルス、非ウイルス性プラスミド、piggyBacなど、多様なデリバリーシステムを選択できます。

CRISPRやRNAiスクリーンにおいて、標的遺伝子やゲノム領域のリストに対するgRNAやshRNA配列のデザインサポートが必要であれば、ベクタービルダーは確立したアルゴリズムと計算パイプラインを用いて、それらをデザインするお手伝いをいたします。2ベクターCRISPRライブラリーの場合、スクリーニング戦略に適した Cas9発現ベクター を構築して、ウイルスにパッケージングすることも受託しています。

プール型ライブラリークローニング

ベクタービルダーはオリゴDNA新規合成、定性進化または両者を組み合わせて変異DNA配列バリアントを作製し、ライブラリーベクターにクローニングしています。変異DNA配列バリアントは最小限のPCRサイクルで増幅され、目的のベクターバックボーンに高カバレッジで同時並行クローニングされます。得られたライブラリーDNAは大腸菌に導入され、対数増殖期にある培養細胞を回収してグリセロールストックを作製します。ウイルスパッケージングを始める前にライブラリーDNAのカバレッジと均一性を検証するためにNGSを行います。

ライブラリーDNAのウイルスパッケージング

目的細胞へライブラリーを導入するために、レンチウイルスやAAVを用いたウイルストランスダクションが必要かもしれません。ベクタービルダーは独自技術と試薬を用いることによって、均一性を維持したままプール型ライブラリーDNAを高タイター、高純度でパッケージングすることができます。そのうえ、スクリーニングに用いることができるライブラリーウイルス液を短い納期でお届けできます。

In vitroもしくはin vivoスクリーニング

ライブラリーを用いたハイスループットスクリーニングは、遺伝子機能解析、医薬品開発のための標的同定、パスウェイ解析、遺伝子マーカーや表現型の検出など幅広い用途のために、膨大なライブラリーを効率的にふるいにかける分析手法です。当社の専門チームは、細胞生存性／生存スクリーニング、薬剤耐性スクリーニング、パスウェイスクリーニング、ターゲットベーススクリーニング、毒性スクリーニング、および特定の研究目的へのカスタムスクリーニングなど、特定の研究ニーズに合わせた、in vitroおよびin vivoの多様なプール型スクリーニングのオプションを提案することができます。

NGSデコンボリューション

ベクタービルダーは、お客様のスクリーニングサンプルのNGS解析によるヒットの同定をお手伝いいたします。当社にサンプルのゲノムDNAを送っていただければ、NGSライブラリーの調製、ハイスループットシーケンスの実施、データ解析、各サンプルの正確なリードカウントをわずか数週間でお届けします。