概要 シークエンスデザイン shRNAターゲットデザイン プライマーデザイン シークエンス解析 シークエンスアラインメント シークエンスドットプロット GC含有率計算 DNA二次構造 DNA逆向き相補鎖 コーディング配列解析 コドン表 コドン最適化 DNA翻訳 Bio Calculator DNA 質量 – モル 変換 RNA 質量 – モル変換 タンパク質 質量 – モル 変換 OD260からの濃度計算 モル濃度からの質量計算 希釈計算 OD600計算 データベース ORF検索
解析ツール シークエンスデザイン shRNAターゲットデザイン ノックダウンスコアおよびターゲット配列からの最適なshRNAデザイン プライマーデザイン Tm、GC含量、配列特異性を最適化したプライマーをデザイン シークエンス解析 シークエンスアラインメント DNA、タンパク質、または翻訳に基づくDNA配列のPair-wise 比較 シークエンスドットプロット ２つのDNAまたはRNA配列の類似配列の2次元比較 GC含有率計算 全配列または特定部位のGC含量の計算 DNA二次構造 塩基対相互作用による二次元構造の予測 DNA逆向き相補鎖 反転配列、相補鎖、逆向き相補鎖配列の検索 コーディング配列解析 コドン表 生物種に特異的なコドンバイアスを調査しよう コドン最適化 生物種、制限酵素切断サイト、クローニング難易度低下などのコドン最適化 DNA翻訳 入力したDNA配列からアミノ酸配列を入手 Bio Calculator DNA 質量 – モル 変換 DNAの分子量と量（質量とモル数）の計算 RNA 質量 – モル変換 RNAの分子量と量（質量とモル数）の計算 タンパク質 質量 – モル 変換 タンパク質の分子量と量（質量とモル数）の計算 OD260からの濃度計算 DNAまたはRNAのOD260値を入力し濃度に変換 モル濃度からの質量計算 目的のモル濃度の溶液を作製するために必要な化合物の質量の計算 希釈計算 目的の濃度と容量を達成するために必要なストック溶液の量を計算 OD600計算 OD600値を入力し、バクテリア（大腸菌）の細胞数に変換 データベース ORF検索 遺伝子同定、アノテーション、機能研究のためのORFの検索と配列情報を取得
