ベクタービルダーの利用方法
VectorBuilderの革新的なオンラインベクターデザインプラットフォームによって、研究者は煩雑なDIYクローニングから開放され、より重要な研究タスクに集中できます。ほんの数クリックでカスタムベクターデザインが終了し、そのままベクター注文と関連サービスの追加注文ができます。
ベクターデザインスタジオの使い方
VectorBuilderへの注文方法
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自分でベクターをデザインするには ベクタービルダーの’s ホームページ, で、 マイベクターをデザインする, をクリックすると、 ベクターシステムを選ぶ ページに移動します。ここでは、利用可能なベクターシステムの包括的なリストが表示されます。次に、それに隣接する デザインする ボタンをクリックして、希望するベクターシステムを選択します。例えば、哺乳類細胞中で興味のある遺伝子を発現させるためのレンチウイルスベクターを設計したい場合、 哺乳類遺伝子発現ベクター セクションの「レンチウイルス」の隣にある デザインする ボタンをクリックします。
すべてのベクターシステムに関する技術情報は、 ベクターシステムの解説 ページでご覧いただけます。
ベクターシステムを選択すると、 ベクターデザインスタジオページ に入ります。ここでは、選んだバックボーンベクターのマップが表示されます。マップ上には2つの種類のコンポーネントがマークされています。1つは固定コンポーネントで、ベクターの基本バックボーンの機能を担います。もう1つはカスタムコンポーネントで、ユーザーが希望するコンポーネントを選択してベクターに追加することができます。カスタムとして選択できるコンポーネントは、プロモーター、目的遺伝子(ORF)、そして薬剤や蛍光などの選択マーカーです。コンポーネントの追加は、ベクタービルダーのデータベースからシーケンスを選択するか、または、カスタムシーケンスのコピー＆ペーストができるオプションがあります。目的遺伝子に、エピトープタグ追加したり、遺伝子変異を導入したりすることもできます。以下に役立つヒントをご紹介します：
データベースからコンポーネントを選択する： ベクタービルダーのデータベースには大きく分けて2種のカテゴリーがあります。1つ目は、研究場面で頻繁に使われているCMV、EF1A、CAGプロモーターなど、既存頻出シーケンスです。 これらは、ドロップダウンメニューから簡単にマウスクリックで選択できるようになっています。２つ目は、ORF、shRNA、gRNAなどを、遺伝子名で検索し、目的遺伝子のシーケンスを取得選択する遺伝子データベースです。 ORFを選ぶ のドロップダウンメニューで、 ORFデータベースから選択するを選び、生物種類を選択し、目的遺伝子名を入力すし、検索をかけます。新しいウインドウで、検索語に関連するすべてのORFがリストアップされます。次に ORFシーケンスをみる をクリックし、NCBIのRefSeq転写産物から目的のシーケンスを選択します。また、エピトープタグの挿入やORFへの変異の導入などORF配列をカスタム編集することもできます。コンポーネントについては、 ベクターコンポーネントの解説 ページで技術的な情報をご覧いただけます。
ORF編集機能： 既にベクターにORFを追加した後でも、ORFにエピトープタグを挿入したり、点変異を導入したりすることができます。ベクターマップ上のORF名をクリックし、ドロップダウンメニューから ORFを編集する を選択してください。これにより、シーケンス編集画面が開き、シーケンスにカスタム変更を加えることができます。また、 タグをつける ボタンをクリックすると、N末端またはC末端に追加する様々なタグの一覧が表示されます。さらに、塩基の追加や削除などを直接シーケンスから編集することもできます。ベクタービルダーのデータベースからシーケンスを呼び出した場合、様々なシーケンスの編集内容の編集履歴が追跡できるようになっています。そのためオリジナルシーケンスに対して、自分がどのような変更を施したか一目瞭然です。シーケンス編集画面には、塩基配列をアミノ酸配列に変換する翻訳機能、逆向き相補配列の表示、コドン最適化など、他にも便利な機能が搭載されています。
単一プロモーターの下流に複数のORFを配置する： 遺伝子発現ベクターを設計する際に、プロモーターの下流に最大4種類のORFをポリシストロンとして配置することができます。 ベクターデザインスタジオ の左上隅にある ORF数を選択する でご希望のORF数を選択してください。プロモーター下流にブランクのORFが作られ、ORFを選択するからカスタムで目的遺伝子をアレンジできます。これらのORFは、１個の融合タンパク質として発現することも、2AやIRESリンカーを間に配置して個別タンパク質として発現することも可能です。
ベクターのデザインが完了したら、 デザインを終了をクリックします。次に、 ベクター情報ページに移動します。そこではアノテーションのついたベクターマップとシーケンスが表示されます。ここでベクターデザインを確認してください。デザインに満足されたら、価格照会を行います。価格と作業日数は通常４８時間以内にメールにて返答が届きます。これらの価格照会済ベクターは、ベクターIDがつけられ、ショッピングカートに入れて見積書作成を介して発注にしたり、ユーザーアカウントに保存したりすることができます。ベクター情報は、論文作成にも使用できるグラフィック入りのPDF形式やGenBank形式のダウンロードにも対応しているため大変便利です。
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ベクタービルダーにベクターデザインを依頼するにはオンライン上で簡単にベクターデザインができないような、複雑性の高いカスタムベクターデザインは、ベクタービルダーのホームページから、 デザインサポートを依頼する ボタンをクリックし、希望するベクターデザインを列記し、シーケンスとともに当社のチームに依頼してください。当社の経験豊かなベクターデザインスペシャリストが無料でご希望のベクターをデザインし、クローニングやプラスミドDNA精製、ウイルスパッケージングなどの関連サービスなどと一緒にベクターの価格構築作業日数をご連絡いたします。
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研究場面でよく使るポピュラーベクターを検索するベクタービルダーのホームページから 遺伝子名からベクターを検索する をクリックすることで、目的遺伝子に対してよく使用されている人気ベクターデザインの検索が可能です。このオプションから遺伝子を検索すると、ベクタービルダーの標準バックボーンを使用した遺伝子発現や遺伝子ノックダウンのベクターデザインがリストアップされます。また、遺伝子によっては、既成品ベクターがあるかどうかも確認することができます。ここから選択したベクターをアノテーションがついたマップとシーケンスを表示して、必要に応じてさらにカスタムベクターのデザイン編集を行うことが可能です。
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発注するには オンライン上でベクターデザインが完了しました。次に、 ベクター情報 ページからクローニング、プラスミドDNA精製、RNA調整ウイルスパッケージングなどの関連サービスの見積書作成と発注を行うことができます。様々な関連サービスが カートに追加 ボタンのクリックで簡単に追加できるようになっています。ショッピングカートページでは、ベクタービルダー・ジャパンの契約一次代理店を介した発注、スポットセールス代理店からの発注、ベクタービルダージャパンからの直販など、様々な購入方法に対応しています。
ショッピングカートのページで 見積書作成 をクリックし、カート内のアイテムに対する見積書をまず作成してください。見積書には、アイテムのみならず、送料手数料、日本国内消費税が自動追加されます。この時に、割引キャンペーンのプロモーションコードもコピー＆ペーストしてください。見積書作成ボタンをクリックすると、この見積書が自動的に選択した契約一次代理店に送信されます。後ほど代理店の担当者が見積書の内容に関して確認にまいります。発注作業は代理店が行います。このようにして作成した見積書は、メニュー項目 マイアカウント > 見積書（VB直販） または見積書（代理店発注）から見積書履歴をご覧頂けます。
ベクタービルダー・ジャパンは、所属先が発行した発注書をアップロードしてください。またはPayPalを介したクレジットカードの即時お支払いにも対応しています。 見積書作成（直販） をクリックし、クレジットカードのお支払手続きに進んでください。ご注文が当社で正式に受理すると、注文確認メールがお手元に届きます。何等かのご確認が必要になった場合、あらためてメールでご連絡させていただきます。また、過去の注文履歴は、マイアカウント > 受注書 からご確認いただけます。当社直販に関するご質問、その他のご質問はベクタービルダー・ジャパンまでメールまたは電話でご連絡ください。