VectorBuilderを使って自分のベクターをデザインすることができます。以下によく使われるコンポーネントの解説があります。
Popular shRNAs
| 名前 | ターゲットシークエンス | ターゲット遺伝子 | ターゲットポジション | 長さ | 説明 |
|---|---|---|---|---|---|
| Scramble[shRNA#1] | CCTAAGGTTAAGTCGCCCTCG | None in human and mouse |
48 bp |
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| Scramble[shRNA#2] | CAACAAGATGAAGAGCACCAA | TurboGFP; none in human and mouse |
48 bp |
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| EGFP[shRNA#1] | CGACGTAAACGGCCACAAGTT | EGFP | 63-83 |
48 bp |
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| EGFP[shRNA#2] | ACGTCTATATCATGGCCGACA | EGFP | 449-469 |
48 bp |
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| LacZ[shRNA#1] | GTCGGCTTACGGCGGTGATTT | LacZ | 1734-1754 |
48 bp |
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| LacZ[shRNA#2] | GTTCCGTCATAGCGATAACGA | LacZ | 1908-1928 |
48 bp |
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| Luciferase[shRNA#1] | ATGTTTACTACACTCGGATAT | Firefly luciferase | 745-765 |
48 bp |
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| Luciferase[shRNA#2] | TGTCCGGTTATGTAAACAATC | Firefly luciferase | 1193-1213 |
48 bp |
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| Scramble[miR30-shRNA#1] | ACCTAAGGTTAAGTCGCCCTCG | None in human and mouse |
63 bp |
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| Scramble[miR30-shRNA#2] | CCAACAAGATGAAGAGCACCAA | TurboGFP; none in human and mouse |
63 bp |
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| EGFP[miR30-shRNA#1] | GCGACGTAAACGGCCACAAGTT | EGFP | 62-83 |
63 bp |
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| EGFP[miR30-shRNA#2] | AACGTCTATATCATGGCCGACA | EGFP | 448-469 |
63 bp |
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| EGFP[miR30-shRNA#3] | AAGAACGGCATCAAGGTGAACT | EGFP | 475-496 |
63 bp |
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| EGFP[miR30-shRNA#4] | CACATGAAGCAGCACGACTTCT | EGFP | 232-253 |
63 bp |
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