shRNAターゲットシークエンス

VectorBuilderを使って自分のベクターをデザインすることができます。以下によく使われるコンポーネントの解説があります。
shRNAターゲットシークエンス
名前 ターゲットシークエンス ターゲット遺伝子 ターゲットポジション レファレンス シークエンス
Scramble_shRNA_target CCTAAGGTTAAGTCGCCCTCG None in human and mouse Cancer Res. 66:9270 (2006) View
EGFP[shRNA#1]_target CGACGTAAACGGCCACAAGTT EGFP 63-83 The RNAi Consortium ID: TRCN0000072193 View
EGFP[shRNA#2]_target ACGTCTATATCATGGCCGACA EGFP 449-469 The RNAi Consortium ID: TRCN0000231756 View
LacZ[shRNA#1]_target GTCGGCTTACGGCGGTGATTT LacZ 1734-1754 The RNAi Consortium ID: TRCN0000072242 View
LacZ[shRNA#2]_target GTTCCGTCATAGCGATAACGA LacZ 1908-1928 The RNAi Consortium ID: TRCN0000072238 View
Luciferase[shRNA#1]_target ATGTTTACTACACTCGGATAT Firefly luciferase 745-765 The RNAi Consortium ID: TRCN0000231737 View
Luciferase[shRNA#2]_target TGTCCGGTTATGTAAACAATC Firefly luciferase 1193-1213 The RNAi Consortium ID: TRCN0000072258 View