コンポーネント (プロモーター、 ORF、 リンカーなど)の名称
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VectorBuilderが所有する一般的なコンポーネントの場合:通称が使われます
例: CMV, EGFP, Neo -
ORFなどVectorBuilderの遺伝子データベースからダウンロードされたコンポーネントの場合:遺伝子記号+ [RefSeq accession番号またはGene ID].
生物種名は、以下のルールに従い、小文字で遺伝子記号の前に追加します。
- ヒト、マウス、およびラットは、それぞれ”h”, “m”, および“r”と 1文字で略称を表記します。
- その他の主要生物種は2文字で略称を表記します。例えば、catは”ct”、chimpanzeeは”ch”、またdogは”dg”になります。
- その他の生物種は3文字で学名の略称を表記し、その後ろに下線を付けます。略称の最初の文字は属名の最初の文字、略称の2番目と3番目の文字は、種名の最初の2文字を表記します。例えば、Drosophila melanogaster は “dme_”になります。
VectorBuilderコレクション ORF: mRho[ORF032112]
Drosophila melanogaster NCBI RefSeqコレクションORF:dme_w[NM_057439.2]
NCBI のE.coliコレクション:eco_nhaA[944758] -
ユーザー独自シークエンスの場合: シークエンス提供時に名称をお知らせください。ユーザー提供の名称は中括弧内に表記されます。ユーザー提供のシークエンスがベクタービルダーのコンポーネント配列と100%同一であった場合、ユーザーよりお知らせいただいた名称は自動的に公式名称に変更されますのでご了承下さい。
例 ユーザー独自シークエンス :{MyGene} -
ユーザーによるシークエンス変更がなされたVectorBuilderデータベースORF: ORFが変異導入目的でユーザーにより編集されたものであることを示すため、アスタリスクマーク(*)がORF名の次に追加されます。ユーザーはこの名称を引き続き使用することもできますが、異なる名称に変更することもできます。名称変更を選択した場合、ユーザーによって変更されたことを示すために中括弧が追加されます。なお“タグをつける”の操作でエピトープタグをつけた場合は、変異とみなされません。ご了承下さい。
例 VectorBuilderデータベースORFに変異導入:hRHO[NM_000539.3]* が自動付与{MyGene}など、ユーザーが独自名に変更することも可能