gRNA特異性スコアの計算方法は?

ベクタービルダー社はFeng ZhangラボのgRNA特異性スコアの計算アルゴリズムを使用しています。ある生物のN(20)NGG配列を標的とするgRNAを例にとると、ゲノム内で標的配列と3つ以下のミスマッチを持つ潜在的なオフターゲット配列すべてを検索します。次にそれぞれの潜在的なオフターゲット配列について、オフターゲットスコアが計算されます。すべてのオフターゲットスコアを集計して最終的なgRNAの特異性スコアを算出します(0から100までで数字が大きいほど高い特異性を示す)。

特異性スコアは大まかな指標に過ぎないことに留意してください。実際の効率性や特異性はスコアが予測するものとは異なる可能性があります。スコアの低いgRNAでもうまく機能することもあります。